Olá Guilherme.
Não consegui fazer algo parametrizável no GRC-NFe... então, resolvi por desenvolvimento mesmo.
Criamos um monitor de Manifesto no ECC e de lá mesmo é disparada a interface de confirmação da operação.
O usuário até pode selecionar mais de um, achando que está em massa, mas o programa controla isso e faz um a um na SEFAZ.
Att,
Rafael